写第二篇论文时，如何把上一篇的 Material Passport 与 Limitations 带入新的 Academic Research Skills 运行？

写第二篇论文时，如何把上一篇的 Material Passport 与 Limitations 带入新的 Academic Research Skills 运行？

【免费下载链接】academic-research-skillsAcademic Research Skills for Claude Code: research → write → review → revise → finalize项目地址: https://gitcode.com/GitHub_Trending/ac/academic-research-skills

你用 Academic Research Skills（ARS）写完第一篇论文后，想开一个新的 ARS 运行来写第二篇，并希望把上一篇的引用记录（Material Passport）和 Limitations、审稿意见带过来。ARS 在设计上刻意不保留跨论文记忆：没有 claim registry、没有自动携带的 limitations、没有审稿历史画像，每次运行都只信任你显式喂进去的东西（见 POSITIONING.md 的 Recorded non-goals）。所以「带入」不是配置某个开关，而是一条学者发起的、每次运行都显式执行的流程，官方把它整理在 docs/cross-paper-workflow.md 里，共三步。本文按操作顺序把这三步展开。

前提：你已经按 docs/SETUP.md 安装好 ARS 的四个 skill（deep-research、academic-paper、academic-paper-reviewer、academic-pipeline），并且上一篇论文的产物还在本地——尤其是它的passport.yaml（如果上一篇是用 ARS 写的），或者你至少能拿到它的参考文献列表。

第一步：把上一篇的 Material Passport 作为声明输入喂给新运行

Passport 本来就是 pipeline 唯一的输入端口。新运行会把它当作声明过的输入处理，而不是当作「可信的历史结论」：

• 每一条语料都会重新走当前运行的正常校验路径。引用存在性校验的结果缓存在本地 SQLite（默认~/.cache/ars/verification.db，条目 90 天过期，缓存 key 按引用计而非按论文计），所以上一篇喂过且仍在缓存内的条目再验证一次成本很低。
• 上一篇跑出来的ok印章只是起点，不是豁免：所有印章按当前运行的策略重新推导。

具体做法：在新运行中，像喂任何文献语料库一样把上一篇的passport.yaml作为输入喂给 ARS。注意 ARS 故意不提供输出目录配置——用户提供的 Material Passport 路径是唯一发现锚点，所以每次运行都要自己指定 passport 的目标路径（见 docs/SETUP.md § Material Passportliterature_corpus[]adapters）。

可选分支：上一篇不是用 ARS 写的

上一篇没有 ARS 产出的 passport 时，走标准 adapter 路径：先安装 adapter 依赖，再运行仓库自带的参考 adapter 从你的文献库生成passport.yaml。以下命令在 ARS 仓库根目录执行；--input换成你自己的语料来源，--passport/--rejection-log是输出文件路径：

# 1. 安装 dev 依赖（adapter 依赖声明在 requirements-dev.txt 中） pip install -r requirements-dev.txt # 2. 选择与你语料来源匹配的参考 adapter，--passport 与 --rejection-log 均为必填 python scripts/adapters/folder_scan.py --input /path/to/pdfs --passport passport.yaml --rejection-log rejection_log.yaml python scripts/adapters/zotero.py --input my-zotero-export.json --passport passport.yaml --rejection-log rejection_log.yaml python scripts/adapters/obsidian.py --input ~/Obsidian/Lit\ Notes --passport passport.yaml --rejection-log rejection_log.yaml

三个参考 adapter 的行为差异（详见 scripts/adapters/README.md）：

• folder_scan.py从 PDF 文件名解析引用元数据，文件名推不出 family + year 的会被拒；
• zotero.py读 Better BibTeX JSON 导出，缺title、authors、可解析年份或source_pointer的条目被拒，季节性日期（如Spring 2024）记为year_unparseable；
• obsidian.py读 Obsidian vault，_templates/与.obsidian/下的文件会被跳过。

语料来源不是这三种时，文档明确让你复制一个参考 adapter 自行改造，契约在 academic-pipeline/references/adapters/overview.md。

验证：schema 校验与 corpus-first 流程

passport 投入任何 ARS 流程之前，先做 schema 校验：

python scripts/check_literature_corpus_schema.py \ --passport /tmp/passport.yaml \ --rejection-log /tmp/rejection_log.yaml

新运行开始后的判断方式：当literature_corpus[]非空且解析通过时，Phase 1 的bibliography_agent（deep-research）与literature_strategist_agent（academic-paper）会进入corpus-first / search-fills-gap流程——先预筛你喂的语料，再用外部数据库搜索补齐缺口，其输出（Annotated Bibliography 或 Literature Search Report）的 Search Strategy 一节会出现 PRE-SCREENED 块，这表示你的语料确实被当作声明输入消费了（见 academic-pipeline/references/literature_corpus_consumers.md）。如果语料缺失、为空或形状检查失败，会走[CORPUS PARSE FAILURE: <cause>]优雅回退，回到纯外部数据库流程——看到这个标记就说明你的 passport 没有进入新运行，需要回去修 adapter 输出。

第二步：把上一篇的 Limitations 作为 Socratic 输入喂给 RQ 孵化

跨论文最有价值的携带通常不是文献表，而是上一篇的Limitations 章节和未解决的审稿意见。做法是把这些内容作为你自己提供的材料带进 deep-research 的socratic模式（RQ 孵化/研究问题澄清阶段）：

1. 粘贴上一篇的 limitations 和审稿意见；
2. 说明你认为它们意味着什么；
3. Socratic mentor 会像对待任何学者提供的材料一样，围绕你的解读追问：gap 的价值、对决策的影响、可行性。

这里有一条硬边界：ARS不会从你的上一篇论文推导下一批 RQ 候选。它可以指出你写出的模式并提问，但不得替你提出、替换、排序、扩展或选择研究问题——这是记录在案的 advisory-not-generation 线（Kong L2，见 docs/design/2026-06-08-kong-255-l2-advisory-not-generation.md）。下一个研究问题仍由你本人撰写，这一步只能帮你把上一篇的教训想清楚。

第三步（可选，Claude Code 用户）：把助手记忆用作个人提醒层

如果你在 Claude Code 里跑 ARS，助手自己的记忆可以当个人提醒用——「上一篇 reviewer 2 质疑了抽样框」「我答应过跟进 X」。但文档给出两条必须记住的约束：

• ARS 的 gate 从不读取也不信任助手记忆。Passport 仍是唯一记录状态；记忆条目只是提醒你按上面第一、二步显式供料的提示，它本身永远不是 gate 的证据、溯源或输入。
• 记忆是你环境的便利设施，不属于工作流契约。上述流程必须在一台完全没有记忆的机器上同样能跑通；如果跑不通，说明状态漏到了 passport 之外。

边界与已知限制

• ARS 不保留跨论文记忆是刻意设计，不是缺失功能：信任环境性跨论文记忆的 gate 等于在评估本次运行无人声明的状态，这正是反泄漏纪律要堵住的通道。因此不要指望「新运行自动知道上一篇」，一切携带都靠你显式喂料。
• 上一篇 passport 里的印章不会原样带过来：当前运行按自己的策略重新推导，缓存命中只是让重新验证变便宜，不改变「重新验证」这件事本身。
• 若引用校验缓存里的某条结果已过期，可用/ars-cache-invalidate <citation_key>清除该 key 的所有缓存行（四个 resolver、所有查询形式均清除），见 docs/SETUP.md 的引用校验缓存一节。

完成第一、二步后，你的新运行就带着上一篇的语料记录和 limitations 思考开始了：passport 侧以 corpus-first 流程的 PRE-SCREENED 块为消费证据，Socratic 侧以 mentor 针对你提供的 limitations 材料提出的追问为确认信号。下一步则按 docs/SETUP.md 中各 skill 的 slash 命令形式启动具体模式即可。

【免费下载链接】academic-research-skillsAcademic Research Skills for Claude Code: research → write → review → revise → finalize项目地址: https://gitcode.com/GitHub_Trending/ac/academic-research-skills