自从六个月前发布Chai-2以来,整个AI领域都在飞速前进,但抗体设计领域却一直停留在「简化片段」阶段(单结构域、scFv等),没人真正搞定临床上真正需要的完整全长单克隆抗体(full-length mAb)。
从头抗体设计——以及更广泛的从头药物设计领域——一直高度专注于优化靶点结合能力。
但要想使这些抗体真正转化为可应用的治疗手段,我们还需考虑一系列其他可开发性标准,包括稳定性、聚集性、免疫原性、可生产性等。
过去几个月,他们惊喜地发现:Chai-2其实早就跨过了这道坎!
最新研究表明,Chai-2已经可以直接设计出药物级全长单克隆抗体,而且:
成功率依然极高,只需测试几十个设计就能出大量命中;
可开发性指标,完全达到甚至媲美已上市的优秀治疗性抗体;
冷冻电镜(Cryo-EM)验证显示,结构预测精度达到亚埃级,表位结合位置分毫不差,功能设计精准实现。
最激动人心的是,他们把Chai-2指向了传统意义上「极难成药」的靶点:
6个GPCR(G蛋白偶联受体)
1个肽-MHC(pHLA,肿瘤新抗原呈现复合物)
结果?成功率依然非常高!
这意味着:「电脑直接设计出可进临床的全长治疗性抗体」已经不再是遥远的梦想,而是正在发生的事实。
Chai-2正在把抗体药物发现真正带入「理性设计」时代。
图:冷冻电镜结构与计算机设计结构叠置对比
上图(A)-(E)展示了五组设计方案的实验测定结构(阴影体积区域)与计算预测结构(卡通模型)叠置,各面板标注相应结构解析精度及全抗体-抗原复合物的RMSD误差值(彩色为实验结构,灰阶为计算结构);(F)展示了三组结构重链CDR3环区对比,灰色为Chai-2预测构象,蓝色为实验解析结构
这种结构精度的突破,意味着朝着「以计算为核心、表位特异性明确」的抗体工程设计常规化,迈出了实质性一步。